La generación de conocimiento en la IBERO va desde la investigación teórica y experimental básica, la investigación aplicada, el desarrollo tecnológico a la producción de obra creativa en cualquiera de sus vertientes. La generación de conocimiento tiene como objetivo fundamental contribuir a mejorar a la sociedad.

El Centro de Investigaciones Interdisciplinarias para el Desarrollo de la Educación, tiene el objetivo de analizar y contribuir a resolver los problemas educativos del país y desde ahí colaborar con la misión de la universidad, en la construcción de una sociedad más libre, justa, productiva y democrática.

En el Instituto de Investigación Aplicada y Tecnología (InIAT) promovemos el bienestar a través de la transformación tecnológica. Creado en el año 2015 para promover el trabajo de co-creación con investigadores e investigadoras de distintas disciplinas para proponer soluciones en cuatro grandes áreas de tecnología: salud, automatización, sustentabilidad y cómputo.